Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USF2Q15853 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
USF2Q15853 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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