Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAF1BQ13112 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHAF1BQ13112 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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