Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL28Q13084 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms