Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRDNQ13061 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms