Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
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