Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXO1Q12778 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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