Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf54Q08AI8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms