Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABPB1Q06547 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms