Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms