Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HSF1Q00613 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms