Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2BP67870 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms