Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVPABLB-1P60509 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms