Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3S2P59780 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3S2P59780 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3S2P59780 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3S2P59780 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3S2P59780 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3S2P59780 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3S2P59780 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3S2P59780 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3S2P59780 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3S2P59780 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms