Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMD8P48556 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMD8P48556 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms