Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL1P40616 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL1P40616 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL1P40616 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms