Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms