Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO1P25800 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO1P25800 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO1P25800 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO1P25800 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO1P25800 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO1P25800 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO1P25800 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO1P25800 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO1P25800 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO1P25800 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO1P25800 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO1P25800 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO1P25800 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO1P25800 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO1P25800 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO1P25800 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO1P25800 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO1P25800 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO1P25800 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO1P25800 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO1P25800 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO1P25800 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO1P25800 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO1P25800 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO1P25800 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO1P25800 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO1P25800 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO1P25800 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO1P25800 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO1P25800 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO1P25800 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO1P25800 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO1P25800 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO1P25800 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO1P25800 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO1P25800 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO1P25800 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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LMO1P25800 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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LMO1P25800 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO1P25800 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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LMO1P25800 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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LMO1P25800 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO1P25800 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO1P25800 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO1P25800 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO1P25800 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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LMO1P25800 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LMO1P25800 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LMO1P25800 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO1P25800 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO1P25800 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO1P25800 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO1P25800 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO1P25800 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO1P25800 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO1P25800 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO1P25800 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO1P25800 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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