Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRDP23468 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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