Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPI1P17947 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPI1P17947 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPI1P17947 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPI1P17947 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPI1P17947 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPI1P17947 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPI1P17947 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms