Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPCAMP16422 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms