Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
IFITM1P13164 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms