Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms