Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LTAP01374 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LTAP01374 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LTAP01374 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LTAP01374 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LTAP01374 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LTAP01374 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LTAP01374 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LTAP01374 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LTAP01374 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LTAP01374 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LTAP01374 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LTAP01374 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LTAP01374 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LTAP01374 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LTAP01374 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LTAP01374 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LTAP01374 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LTAP01374 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LTAP01374 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LTAP01374 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LTAP01374 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LTAP01374 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LTAP01374 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms