Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN7O95471 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms