Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KDM4AO75164 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDM4AO75164 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KDM4AO75164 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDM4AO75164 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDM4AO75164 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDM4AO75164 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDM4AO75164 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDM4AO75164 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KDM4AO75164 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDM4AO75164 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDM4AO75164 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KDM4AO75164 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KDM4AO75164 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDM4AO75164 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KDM4AO75164 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDM4AO75164 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KDM4AO75164 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KDM4AO75164 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KDM4AO75164 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KDM4AO75164 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KDM4AO75164 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KDM4AO75164 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KDM4AO75164 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KDM4AO75164 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KDM4AO75164 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KDM4AO75164 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KDM4AO75164 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KDM4AO75164 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDM4AO75164 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDM4AO75164 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDM4AO75164 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDM4AO75164 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KDM4AO75164 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KDM4AO75164 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KDM4AO75164 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
KDM4AO75164 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KDM4AO75164 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KDM4AO75164 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDM4AO75164 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDM4AO75164 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDM4AO75164 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDM4AO75164 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDM4AO75164 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDM4AO75164 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms