Protein–RNA interactions for Protein: O43482

OIP5, Protein Mis18-beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OIP5O43482 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OIP5O43482 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OIP5O43482 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OIP5O43482 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OIP5O43482 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OIP5O43482 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OIP5O43482 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OIP5O43482 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OIP5O43482 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OIP5O43482 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OIP5O43482 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OIP5O43482 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OIP5O43482 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OIP5O43482 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OIP5O43482 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OIP5O43482 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OIP5O43482 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OIP5O43482 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OIP5O43482 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OIP5O43482 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
OIP5O43482 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OIP5O43482 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms