Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF113AO15541 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF113AO15541 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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