Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PATL2C9JE40 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PATL2C9JE40 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms