Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HSPB2A8KAH6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HSPB2A8KAH6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms