Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C3Q9Y5Q9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms