Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF330Q9Y3S2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF330Q9Y3S2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF330Q9Y3S2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF330Q9Y3S2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF330Q9Y3S2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF330Q9Y3S2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF330Q9Y3S2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF330Q9Y3S2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF330Q9Y3S2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF330Q9Y3S2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF330Q9Y3S2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF330Q9Y3S2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF330Q9Y3S2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF330Q9Y3S2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF330Q9Y3S2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF330Q9Y3S2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF330Q9Y3S2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF330Q9Y3S2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF330Q9Y3S2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF330Q9Y3S2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF330Q9Y3S2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF330Q9Y3S2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF330Q9Y3S2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms