Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms