Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX6Q9UNH7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms