Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHORDC1Q9UHD1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms