Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAE1Q9UBE0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms