Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms