Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLE3Q9NRF9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms