Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms