Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS4Q9BT78 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms