Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORCS2Q96PQ0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms