Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC74

RBBP8NL, RBBP8 N-terminal-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8NLQ8NC74 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms