Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms