Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf135Q5VTT2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms