Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCA8Q53HL2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms