Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM16Q2WEN9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM16Q2WEN9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms