Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms