Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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PCK2Q16822 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCK2Q16822 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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