Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIST3H3Q16695 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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