Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGCAQ16586 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SGCAQ16586 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SGCAQ16586 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SGCAQ16586 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SGCAQ16586 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SGCAQ16586 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SGCAQ16586 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SGCAQ16586 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SGCAQ16586 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SGCAQ16586 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SGCAQ16586 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCAQ16586 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCAQ16586 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms