Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CSRP2Q16527 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSRP2Q16527 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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